1999 m. rugpjūčio 17 d. LR susisiekimo ministerija kreipėsi į LR užsienio reikalų ministeriją su prašymu tarpininkauti dėl Japonijos ekspertų skyrimo atlikti Klaipėdos valstybinio jūrų uosto plėtros galimybių studiją.
Japonijos ambasada Lietuvoje 2002 m. gegužės 8 d. nota Nr. L/02/30 pranešė, kad Klaipėdos uosto plėtros projekto Lietuvoje studija bus atliekama po apsikeitimo notomis tarp Japonijos ambasados ir LR užsienio reikalų ministerijos.
Japonijos Vyriausybė skyrė subsidiją Lietuvos Vyriausybei Klaipėdos valstybinio jūrų uosto dalies plėtros projekto galimybių studijai atlikti.
2002 m. LR susisiekimo ministerija, VĮ Klaipėdos valstybinio jūrų uosto direkcija ir Japonijos tarptautinio bendradarbiavimo agentūra (Japan International Cooperation Agency) pasirašė Klaipėdos uosto plėtros studijos darbų apimtį (techninę užduotį).
Uosto plėtros projekto studijos darbai pradėti 2003 m. kovo 31 d.
Minėtos studijos pagrindu paruošta:
2003 m. kovo pabaigoje į Lietuvą atvyko didžioji dalis studijos grupės ekspertų, vadovaujami p. Kiyokuni Okubo. 2003 m. balandžio pradžioje trumpam vizitui į Klaipėdą atvyko studijos patarėjų grupė. 2003 m. balandžio 14 d. LR susisiekimo ministerijoje pristatyta įžanginė ataskaita, kuriai pritarė susisiekimo ministro įsakymu sudarytas studijos priežiūros komitetas.
Lietuvos Respublikos uosto plėtros projekto studija atlikta per 16 mėnesių: darbai pradėti 2003 m. kovo 31 d. ir baigti 2004 m. liepos 31 d.